原生生物和原生动物在生物分类体系中存在包含关系，原生动物属于原生生物的一部分，它们的区别如下：

一、定义范畴

原生生物：是一类最简单的真核生物，包含多种单细胞或简单多细胞生物，其细胞结构复杂程度高于原核生物，具有细胞核和多种细胞器。

原生动物：是原生生物中的一个主要类群，特指那些单细胞、能够运动且具有异养生活方式（不能通过光合作用自行制造食物，需摄取其他生物或有机物质获取营养）的真核微生物。

二、结构特征

原生生物：结构多样，包括单细胞、群体或简单多细胞形式。例如，藻类可能具有细胞壁，细胞内含有叶绿体等细胞器用于光合作用；黏菌在不同生活阶段呈现不同形态结构，营养阶段类似变形虫，繁殖阶段形成孢子结构。

原生动物：单细胞结构，虽然简单但具有完成各种生命活动的基本结构，如细胞膜、细胞质、细胞核，以及一些特化的细胞器用于运动、摄食和排泄等功能，如草履虫具有纤毛用于运动，变形虫通过伪足进行移动和摄食。

三、营养方式

原生生物：营养方式多样，藻类能进行光合作用制造有机物，属于自养型生物；原生动物通过吞噬、胞饮或渗透等方式摄取有机颗粒、细菌、藻类等，属于异养型生物；还有些原生生物可兼性营养，既能进行光合作用又能摄取现成有机物。

原生动物：主要为异养型，通过吞噬作用摄取食物，如草履虫利用口沟摄取细菌等食物颗粒，在细胞内形成食物泡进行消化；疟原虫寄生在宿主细胞内，从宿主细胞摄取营养物质。

四、生态角色

原生生物：在生态系统中扮演多种角色，藻类是初级生产者，为生态系统提供氧气和有机物质，是食物链的基础环节；原生动物在物质循环中作为分解者，分解有机物质，促进营养元素循环，部分种类与其他生物共生，影响生态系统的物质和能量流动。

原生动物：主要作为消费者，在食物链中处于不同营养级，通过捕食其他微生物或有机颗粒获取能量，对控制微生物种群数量和维持生态平衡有一定作用，部分寄生原生动物会影响宿主种群数量和分布。

五、分类多样性

原生生物：包含众多不同类群，除原生动物外，还包括藻类（绿藻、硅藻、红藻等）、黏菌等，各类群在形态、结构、生理和生态方面差异较大，分类依据多种特征进行。

原生动物：根据运动细胞器的不同分为不同纲，如具有鞭毛的鞭毛虫纲（眼虫等）、具有纤毛的纤毛虫纲（草履虫等）、通过伪足运动的肉足虫纲（变形虫等），以及一些寄生性原生动物（疟原虫、孢子虫等），分类主要基于运动方式和生活史特点。

总之，原生生物包括原生动物，而原生动物属于微生物。