物种库
 
首页 > 疫情防控理论 > 理论研究

北京大规模流行病学筛查应该怎么做?哈佛最新研究给启示

媒体:“医学界”微信公众号  作者:朱雪琦
专业号:钱佳弘 2020/6/30 8:34:53

为了控制流行病,多次检测、短时间出结果才是最重要的。

为了控制从新发地开始的疫情,北京正在全市范围内进行大规模的流行病学监测。

官方通报,截至6月28日12时,北京全市累计完成采样829.9万人,已完成检测768.7万人,基本完成“应检尽检”人员的动态清零。

6月28日,北京新增确诊病例量再次回到个位数,但是“假阴性”问题,为日渐明朗的防控局势投下一丝阴影。北京6月25日11例新增确诊病例中,有5例首次核酸检测为阴性。其中,3人核酸检测结果为阴性,但血清抗体检测为阳性,最终被确诊。

检测的“假阳性”、“假阴性”、什么时候出检测报告、是否需要多次检测,成为过去两周里北京市民最关心的事情。

来自科罗拉多大学和哈佛大学的研究人员,同样在关注不同的流行病监测模式的有效性问题。但是他们发现,病毒筛检手段灵敏度的重要性被高估了,检测频率和短时间出结果更加重要

研究人员通过大量模拟测试发现,在全人群的水平上,每14天进行一次冠状病毒检测,最终的感染总数和没有检测一样,都会快速攀升。但是,出于成本和效率考虑,如果使用不那么灵敏的检测方法,但每周进行检测,结合隔离措施,仍然可以控制疫情的爆发。

这项研究6月22日发表在预印本平台medRxiv,目前尚未经过同行评议。

病毒筛检手段

论文一开始,研究者就开宗明义地指出:由于在感染病毒的各个阶段,甚至无症状感染者都能够传播病毒,强有力的流行病监测对于现阶段在全球范围内控制病毒传播,促进社会的重新开放尤为重要。

其中,病毒筛检手段往往是最为重要的工具。目前,即时定量聚合酶连锁反应(Real-time Quantitative Polymerase Chain Reaction,简称RT-qPCR)是检测新冠病毒最准确有效的黄金标准。然而,qPCR仍然昂贵。而且作为一种基于实验室的检测方法,样品-报告时间通常很长,在 24-48 小时之间。

新的筛检技术的发展有可能显著降低成本,从而扩大检测范围,提高检测频率,并显著减少出结果的时间。但是,这些方法在很大程度上并不符合分析灵敏度的黄金标准,阻碍了它们更广泛的应用。

在进一步的介绍这一研究前,首先需要清楚一个概念——分析灵敏度,也被称为检测限(limit of detection ,简称LOD),指的是可检测的最低分析物浓度。

RT-qPCR的检测限为103cp/ml,更便宜也更快的检测方法,如RT-LAMP和快速抗原检测的检测限则较高,大约是105cp/ml。

人体感染新型冠状病毒后,会有一段时间的潜伏期,在此期间病毒滴度通常过低而无法被检测到,随后病毒呈指数增长,病毒载量和传染性达到峰值,之后病毒水平下降直到被完全清除。

根据新冠病毒载量的动力学模型,在病毒指数增长期间,103cp/ml 和 105cp/ml 之间的时间窗很短。虽然对SARS-CoV-2 的时间窗尚没有严格的定义,但对于其他呼吸道病毒,例如流感病毒,以及 SARS-CoV-2 在雪貂身上的传播模型来说,这个时间窗口大约是一天。

为了弄清使用不同的病毒检测方法,不同的监测策略对全人群感染水平的影响,研究者使用数学建模的方法,来分析检测手段的灵敏度、检测频率和出报告的时间长短,对流行病监测效果的影响。

流行病学启示

论文的主要作者科罗拉多大学博尔德分校计算机科学系教授 Dan Larremore 在 Twitter 上解释了这项研究的几个主要的发现:首先,检测方法的灵敏性没有我们想象的那么重要。qPCR相比其他检测的灵敏度优势,只体现在12小的时间窗口里。

研究发现:流行病检测的有效性取决于检测频率/论文截图

其次,只有高频率的检测,才能利用这个很短的时间窗口。因此,研究者指出,如果是出于监测流行病的目的,那么不应该排除灵敏度较低的检测方法

考虑到新冠病毒载量动力学的模式,研究者将病毒的传染性建模为病毒载量的函数,来对流行病的监测效果进行分析。研究者改变检测的频率,从每天检测一次到每14天检测一次。采用类似于 RT-qPCR 和 RT-LAMP/快速抗原测试,检测限为103cp/ml和105cp/ml两种不同的检测手段。同时,研究使用了两种不同的流行病学模型,以确保重要的观察结果独立于特定的模型。

研究发现,检测频率是影响流行病是否得到控制的主要驱动因素,使用更灵敏的检测方法只能提供很小的改善。

同时,模拟结果表明,在没有监测或两周做一次检测的情况下,病毒的传播都得不到控制。而每周一次检测,无论检测限是103cp/ml还是105cp/ml,配合积极病例隔离,都能有效的控制病毒的传播。

流行病监测中还有一个重要影响因素,从收集检测样本到报告检测结果的时间。研究者通过建模发现,报告的延误将大大影响病毒传播的控制效果。这一结论再一次强调,快速报告检测结果在任何流行病监测中都是至关重要的

总而言之,有效的流行病监测,主要取决于检测的频率和报告结果的速度,而提高检测的敏感性仅能略微提高监测的效率。

当然,研究者提醒,用于临床诊断的检测手段不同于流行病筛查,灵敏性对于临床诊断依然非常重要。研究者也指出了这项研究的局限性:所有的数据和模型都建立目前对新冠病毒动力学和传染性的理解上。而“这里有很多未解的谜团,持续的研究将是很有价值的”。

最后,研究者建议,食品药品管理局、政府和其他机构应该鼓励开发和使用具有替代性的、更快、成本更低的检测方法,即使它们的灵敏度较低。“如果现在的新冠检测点,能够更快的出结果,或者能够提高检测频率,我们的研究结果表明,这将具有很高的流行病学价值。”

来源:医学界

作者:朱雪琦

审稿:田栋梁

校对:臧恒佳

责编:郑华菊

阅读 1333
我也说两句
E-File帐号:用户名: 密码: [注册]
评论:(内容不能超过500字。)

*评论内容将在30分钟以后显示!
版权声明:
1.依据《服务条款》,本网页发布的原创作品,版权归发布者(即注册用户)所有;本网页发布的转载作品,由发布者按照互联网精神进行分享,遵守相关法律法规,无商业获利行为,无版权纠纷。
2.本网页是第三方信息存储空间,阿酷公司是网络服务提供者,服务对象为注册用户。该项服务免费,阿酷公司不向注册用户收取任何费用。
  名称:阿酷(北京)科技发展有限公司
  联系人:李女士,QQ468780427
  网络地址:www.arkoo.com
3.本网页参与各方的所有行为,完全遵守《信息网络传播权保护条例》。如有侵权行为,请权利人通知阿酷公司,阿酷公司将根据本条例第二十二条规定删除侵权作品。