据港媒报道，香港理工大学医疗科技及资讯学系副教授萧杰恒27日在一个电台节目表示，其研究团队为近日香港出现的确诊病例进行基因排序，发现本地确诊病例与欧洲输入病例的基因突变特征相似，相信新一波疫情源头，很可能是国外输入。

另外，香港理大随机抽取今次疫情中26个病人的样本分析，发现病人的病毒均带有D614G基因变异，包括近期多个大型集体感染事件都发现了此类型的病毒，而早前来自高危地区豁免人士的确诊者中，亦发现类似这种基因变异，由此相信第3波疫情很大机会源自豁免检疫人士。

香港理大团队取得第三波疫情的26个本地患者样本，以及6个输入个案样本，发现均属于GRK，即D614G类型的变种病毒株。萧杰恒相信此病毒株最初源自欧洲，并于三月上旬首次在香港出现，当时患者是一名从马德里回港的国泰空服员，但当时并无扩散至社区。

萧亦发现，香港患者的病毒株虽属同类，但当中仍存在微小突变，推断疫情来自至少三条传播链。“不是单一个人导致社区暴发，而系透过多个点触发。”

26个本地样本当中，有19个病毒株是完全一样，并分布在不同地区，包括彬记群组、的士司机、慈云山港泰护老中心、沙田水泉澳村、屯门富临生日会群组等。他们的病毒株跟来自菲律宾和巴基斯坦的输入个案非常接近，遂他估计这两个国家是导致本地主流暴发的源头。但团队暂未成功配对，与输入个案病毒株完全相同的本地个案，是未能解通的“断层”问题。

而第二条传播链来自哈萨克机组人员，即获豁免检疫人士。萧杰恒称，第1326宗个案、从哈萨克返港42岁男机组人员的病毒株，与第1319宗个案、居铜锣湾礼顿山31岁男子完全一样。据卫生防护中心，第1326宗个案来港后，居于铜锣湾皇冠假日酒店，位置邻近第1319宗个案的住所。他相信该酒店先后让不少机组人员居住，并肯定他们与第1319宗个案确诊有关。

至于第三条传播链涉及第1558宗个案、居西贡相思湾村的患者，其病毒株与上述个案稍有不同，但团队暂未配对出病毒株相近的输入个案。