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宁陕齿突蟾和六盘齿突蟾线粒体基因组比较及中蛙亚目系统发育研究

媒体:陕西师范大学  作者:内详   专业号:六盘齿突蟾 2022-03-26 17:47:38

无尾目(Anura)是脊椎动物两栖类一个较大的研究较深入的类群,目前GenBank已收录超过200种无尾目线粒体基因序列.中蛙亚目(Mesobatrachia)是无尾目中一个类群,物种种类众多,多样性强,但目前仅有21种物种的线粒体基因组被报道,研究尚不完善.齿突蟾属(Scutiger)作为中蛙亚目中一个重要的分类单元,包含物种多为稀有濒危种类,然而缺乏线粒体全基因组序列报导,对该属的分类研究造成许多困扰.基于此,本研究对齿突蟾属的物种宁陕齿突蟾(Scutiger ningshanensis)和六盘齿突蟾(Scutiger liupanensis)进行线粒体基因组测序并分析,以期为齿突蟾属及相关物种的分类学研究进一步提供分子研究证据.研究采用PCR技术,结合引物步移法及基因组步移法进行产物测序,利用生物信息学手段对测得的片段进行拼接,注释和分析,结合NCBI数据库中已收录的21种中蛙亚目线粒体基因组序列信息,分别以PCGs,rRNAs,rRNAs PCGs为数据集,以新蛙亚目的中国林蛙(Rana chensinensis)以及中国雨蛙(Hyla chinensis)为外群,采用最大简约法(Maximum Parsimony, MP),最大似然法(Maximum Likehood, ML)和贝叶斯推论法(Bayesian Inference, BI)构建系统发育树,进行中蛙亚目各物种的系统发育关系的分析.

本文来自[1]范瑞娜. 宁陕齿突蟾和六盘齿突蟾线粒体基因组比较及中蛙亚目系统发育研究[D]. 陕西师范大学, 2016.的摘要部分。

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